Odlukom Drugog Kongresa osnovan je Nacionalni komitet Unije evropskih federalista Srbije, kao novi organ organizacije. Na osnovu odredbi statuta UEF-a Nacionalni komitet je telo koje utvrđuje i vodi opštu politiku UEF-a između dva Kongresa, a njegovi osnovni zadaci jesu da donosi opšte smernice i preporuke za rad UEF-a u skladu sa ciljevima UEF-a; donosi rezolucije i druge akte kojima utvrđuje opštu politiku UEF-a u skladu sa ciljevima UEF-a; utvrđuje platformu za nastup UEF-a pred međunarodnim organizacijama i udruženjima; predlaže Izvršnom birou međunarodnog sekretara UEF-a; razmatra i usvaja godišnji plan rada na predlog Izvršnog biroa; predlaže Izvršnom birou otvaranje lokalnih i regionalnih odbora UEF-a.
Prvi Kongres Unije evropskih federalista održan je 2. oktobra 2009. godine. Na njemu je potvrđen sastav organa sa Osnivačke skupštine, te doneta odluka o podnošenju aplikacije za dobijanje statusa Sekcije kandidatkinje za punopravno članstvo u Međunarodnom UEF-u.
